Akademik Görevleri

  • Halen 2009

    Öğretim Görevlisi

    Karabük Üniversitesi, Meslek Yüksekokulu

İdari Görevleri

  • Halen 2009

    Öğretim Görevlisi

    Karabük Üniversitesi, Bilgi İşlem Daire Başkanlığı

Egitim Bilgileri

  • Ph.D. Halen

    Doktora, Bilgisayar Mühendisliği

    Karabük Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü

  • M.Sc.2011

    Yüksek Lisans, Elektronik ve Bilgisayar Eğitimi

    Karabük Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü

  • B.Sc.2008

    Lisans, Bilgisayar Öğretmenliği

    Zonguldak Karaelmas Üniversitesi, Karabük

  • A.Sc.2003

    Önlisans, Bilgisayar Donanımı

    Uludag Üniversitesi, Teknik Bilimler Meslek Yüksekokulu

Proje Ekibi

Öğr.Gör. Abdullah ELEN

Yazılım Geliştirme Uzmanı

+ Takip et

Türker TOKU

Veritabanı Uzmanı

+ Takip et

Yrd.Doç.Dr. M. Kamil TURAN

Doktora Tez Danışmanı

+ Takip et

Arş.Gör. Eftal Şehirli

Yazılım Geliştirme Uzmanı

+ Takip et

Murat Korkmaz

Yazılım Geliştirme Uzmanı

+ Takip et

Uzman ve Deneyimli Personel

Proje ekibimiz alanında uzman ve deneyimli kişilerden oluşmaktadır. Ekibimiz ile birlikte bilimsel çalışmaların yanı sıra endüstriyel çözümler de üretmekteyiz.

Araştırma Projeleri

  • image

    UBYS

    Üniversite Bilgi Yönetim Sistemi

    Kısa adı UBYS olan Üniversite Bilgi Yönetim Sistemi, üniversiteler için geliştirilmekte olan geniş kapsamlı bir otomasyon sistemidir. Proje web adresi ubys.karabuk.edu.tr

  • image

    Title of Preject

    Very short description of the project.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

  • image

    Title of Preject

    Very short description of the project.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

  • image

    Title of Preject

    Very short description of the project.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation ullamco laboris nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. Duis aute irure dolor in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.

Yayınları Filtrele:

Yıla göre sırala:

Genetik Algoritma ile Çoklu Dizi Hizalama Probleminin Çözümü

Abdullah Elen, M. Kamil Turan
Poster XIII. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi, Ekim 2013, Aydın/Türkiye.

Abstract

Multiple DNA sequence alignment problem is an important and fundamental research topic of bioinformatics. DNA, RNA, or protein sequences to be arranged and detecting of similar regions and the status of relationship as functional, structural or evolutionary analysis of these sequences seen as a difficult problem. Nowadays, most computers have the ability to make a quick calculation and processing, although multiple sequence alignment procedures with the traditional solution methods still fail. Furthermore, some of the methods of producing approximate solutions to hang out in the local optimum. In this study, using the methods of genetic algorithm for solution of the multiple sequence alignment problem and considering the query sequences has an evolutionary relationship, was to develop a method for optimal alignment results.

Karabük Üniversitesi Bilgi Sistemi Android Uygulaması

Emrullah Sonuç, Yasin Ortakcı, Abdullah Elen
Conference Papers Akademik Bilişim Konferansı 2013, Antalya/Türkiye.

Abstract

Günümüzde mobil cihazlar başlangıçtaki kullanım amacı olan cep telefonluğu görevini aşmış ve birer bilgisayar görevini üstelenerek, akıllı cep telefonu olarak kullanılmaya başlanmıştır. Android işletim sistemi ise mobil cihazlara yönelik geliştirilmiş ve günümüzde mobil cihazlar üzerinde en yaygın kullanıma sahip mobil işletim sistemlerinden biridir. Bu çalışmada Karabük Üniversitesi'ne yönelik Android cihazlarda kullanılmak üzere bir bilgi sistemi hazırlanmıştır. Bu uygulama sadece Karabük Üniversitesi öğrencileri veya personeline yönelik değil, Karabük Üniversitesi hakkında bilgi sahibi olmak isteyen ya da Karabük Üniversitesi ile ilgili gelişmeleri takip etmek isteyen Android kullanıcılarına da hizmet verecek şekilde geliştirilmiştir.

Identification of Column Edges of DNA Fragments by Using K-Means Clustering and Mean Algorithm on Lane Histograms of DNA Agarose gel Electrophoresis Images

Muhammed Kamil Turan, Eftal Şehirli, Abdullah Elen, İsmail Rakıp Karaş
Conference Papers Seventh International Conference on Digital Image Processing (ICDIP 2015), Volume 9631, July 2015, Pages 6

Abstract

Gel electrophoresis (GE) is one of the most used method to separate DNA, RNA, protein molecules according to size, weight and quantity parameters in many areas such as genetics, molecular biology, biochemistry, microbiology. The main way to separate each molecule is to find borders of each molecule fragment. This paper presents a software application that show columns edges of DNA fragments in 3 steps. In the first step the application obtains lane histograms of agarose gel electrophoresis images by doing projection based on x-axis. In the second step, it utilizes k-means clustering algorithm to classify point values of lane histogram such as left side values, right side values and undesired values. In the third step, column edges of DNA fragments is shown by using mean algorithm and mathematical processes to separate DNA fragments from the background in a fully automated way. In addition to this, the application presents locations of DNA fragments and how many DNA fragments exist on images captured by a scientific camera.

mktBioInformatic: A Simplified Python's Framework Used for Routine Bioinformatic Analysis

Muhammed Kamil Turan, Seyit Ali Kayış, Eftal Şehirli, Abdullah Elen
Poster Research | Eylül 06, 2015 | DOI: 10.13140/RG.2.1.4289.8646

In the framework, there exist powerful tools such as sequence, gene and locus definitions, nucleic acids belonging to these groups, mRNA, protein, collecting intron and exon sequences from databases, local and global alignment, consensus sequence analysis, housekeeping gene analysis, interpretation and analysis of rtPCR data and analysis of gel electrophoresis images.

Solving of Scheduling Problem with Heuristic Optimization Approach

Abdullah Elen, İbrahim Çayıroğlu
Journal Paper Journal of Technology, Volume 13, Issue 3, April 2010, Pages 159-172

Abstract

In this study, solution of course scheduling problems in student affairs automation used in the universities was carried out using Genetic Algorithm method which is one of Heuristic Optimization approaches.Scheduling problem is the process of placing the works to be done in time intervals at optimum level withinthe constraints. The solution of this problem at universities becomes impossible with analytic methods sincesolution space is too wide and there are many constraints. Therefore, giving the best solutions for this type of problems, Genetic Algorithm method was used with a new approach by examining the parameters giving thebest results.The performance of the Algorithm was measured by conducting applications over the actual data from theuniversity (504 instructors, 4163 course, 203 classrooms and 10525 students). Algorithm was developed using ASP.NET, C# programming language and SQL Server Database. Interfaceand reporting pages of student affairs automation were also added to the program for practical use of the Algorithm.

A Heuristic Optimization Approach for A Real-World University Timetabling Problem

İbrahim Çayıroğlu, Abdullah Elen
Journal Paper Advances in Computer Science and Engineering, Volume 9, Issue 2, October 2012, Pages 103-131.

Abstract

In this study, the solution to the problem of automating the course timetabling used at the universities through the student affairs automation tool has been established by applying one of the heuristic optimization approaches, namely, the genetic algorithm method. The scheduling problem involves the optimal placing of tasks in time slots in accordance with designated constraints. Solving this problem through analytical methods at universities is becoming impossible due to the magnitude of the solution space and the wide range of constraints. Therefore, the genetic algorithm method, which is known to yield very good results for such problems, is used as a new approach, along with the investigation of parameters with the best results.

The performance of the algorithm is measured using real data from the university. In order to enable the practical use of the algorithm, the genetic algorithm method is implemented within the student affairs automatization tool.

Development and Implementation of Web Based Fuzzy Logic Content for Distance Education

Abdullah Elen, Raif Bayır, Ahmet Albayrak
Conference Papers 1st International Fuzzy Systems Symposium (FUZZYSS’09), 2009, pages 392-399, Ankara/Türkiye.

Abstract

#

Bilgisayar Destekli Otomotiv Test Standının Internet Üzerinden Uzaktan Eğitim Amaçlı Kullanımı İçin Kullanıcı Arayüzlü Yazılım Tasarımı

Abdullah Elen, Raif Bayır
Conference Papers 5rd. International Advanced Technologies Symposium, 2009, pages 2007-2012, Karabük/Türkiye.

Abstract

Bu çalışmada Bilgisayar Destekli Otomotiv Test Standının (BDOTS) İnternet üzerinden gerçek zamanlı denetimi gerçekleştirilmektedir. İçten yanmalı motora ait (devir, tork, sıcaklık, debi vb.) veriler algılayıcılar kullanılarak, veri alış-veriş kartı aracılığı ile bilgisayar ortamına aktarılmaktadır. BDOTS’a uzaktan erişim ve kontrol işlemleri .NET platformunda C# dili kullanılarak Server (Sunucu) ve Client (İstemci) uygulamaları ile gerçekleştirilmiştir. Sunucu tarafı yazılım ile BDOTS’a ait ölçüm değerleri ve ölçüm grafikleri örnekleme zamanına bağlı olarak görülebilmekte ve istenildiği anda istemci bilgisayarlar aracılığıyla bu ölçümler gönderilebilmektedir. İnternet tabanlı uzaktan eğitim için gerçek zamanlı görüntü ve ses paketlerinin de İstemci bilgisayarlara gönderilmesi sağlanmaktadır. Bu sayede tehlikeli deneylerin uzaktan kontrol edilerek yapılması sağlanmıştır. Birçok kullanıcının yapılan deneylerin İnternet üzerinden izlenebilmesi sayesinde deney tekrarı azaltılmaktadır. Bu da ekonomik katkı sağlamaktadır. Deney yapılan ortamda öğrencilerin bulunmaması zehirli gazlarında solunmasını önlemektedir. Geliştirilen bu yazılım, uzaktan eğitim sisteminde, tehlikeli ve maliyeti yüksek deney düzeneklerine de rahatlıkla uyarlanabilir.

Aktif Dönem Dersleri

  • Present 1995

    BLM199 - Yapay Zeka Mühendisliği

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed ultrices ac elit sit amet porttitor. Suspendisse congue, erat vulputate pharetra mollis, est eros fermentum nibh, vitae rhoncus est arcu vitae elit.

  • Present 2003

    SELC 8160 Molar Endodontic Selective

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed ultrices ac elit sit amet porttitor. Suspendisse congue, erat vulputate pharetra mollis, est eros fermentum nibh, vitae rhoncus est arcu vitae elit.

  • Present 2010

    Endodontics Postdoctoral AEGD Program

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed ultrices ac elit sit amet porttitor. Suspendisse congue, erat vulputate pharetra mollis, est eros fermentum nibh, vitae rhoncus est arcu vitae elit.

Önceki Dönem Dersleri

  • 1997 1995

    Preclinical Endodnotics

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed ultrices ac elit sit amet porttitor. Suspendisse congue, erat vulputate pharetra mollis, est eros fermentum nibh, vitae rhoncus est arcu vitae elit.

  • 2005 2003

    SELC 8160 Molar Endodontic Selective

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed ultrices ac elit sit amet porttitor. Suspendisse congue, erat vulputate pharetra mollis, est eros fermentum nibh, vitae rhoncus est arcu vitae elit.

  • 2011 2010

    Endodontics Postdoctoral AEGD Program

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed ultrices ac elit sit amet porttitor. Suspendisse congue, erat vulputate pharetra mollis, est eros fermentum nibh, vitae rhoncus est arcu vitae elit.

  • 2011 2010

    Endodontics Postdoctoral AEGD Program

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed ultrices ac elit sit amet porttitor. Suspendisse congue, erat vulputate pharetra mollis, est eros fermentum nibh, vitae rhoncus est arcu vitae elit.

  • 2011 2010

    Endodontics Postdoctoral AEGD Program

    Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed ultrices ac elit sit amet porttitor. Suspendisse congue, erat vulputate pharetra mollis, est eros fermentum nibh, vitae rhoncus est arcu vitae elit.

Görüsme Saatleri

You can find me at my office located at Stanford University Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua.

I am at my office every day from 7:00 until 10:00 am, but you may consider a call to fix an appointment.

At My Work

You can find me at my Work located at Stanford University Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua.

I am at my office every day from 7:00 until 10:00 am, but you may consider a call to fix an appointment.

At My Lab

You can find me at my office located at Stanford University Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipisicing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua.

I am at my office every day from 7:00 until 10:00 am, but you may consider a call to fix an appointment.